生物特征识别技术的应用是通过系统来实现的。生物特征识别系统的被接受或应用，不仅依赖于它的可操作性、技术性等特征，还要考虑最终的应用情况和资金情况。从研究的角度出发，生物特征识别系统包括系统层、算法层、评估层和应用层4个层次。
 

　　长期以来，由于不同生物特征技术研发组织采用算法的不同及评测侧重点的不同，生物征识别系统性能的评测方法存在着很大的差异。生物特征识别系统性能的测试和评估一直是未能解决的问题。目前生物特征识别技术迅速发展的现状迫切要求建立标准测试数据库，并提出*的系统评测标准。
 

　　一般来说生物识别系统是易施行，为了生物特征识别技术的提高和广泛应用，应该使得生物特征识别技术易于系统集成和施行。现在利用和集成生物特征识别技术还不是一件容易的事情，原因之一就是缺乏广泛的工业标准。为了把生物特征识别技术推向主流的身份认证市场，鼓励其在现实环境中的评估，促进其在终端解决方案的集成，都是非常重要的。
 

　　在费用方面，尽管已经把生物特征识别应用到商业解决方案中，但仍然存在一些总体成本的考虑。包括涉及到的设备、安装、培训等花费。软件和系统操作、维护也应该加入成本预算里。例如：指纹门禁系统，指纹考勤机已经是大量的运用到了商业方面。