羊源性成分探针法荧光定量PCR试剂盒通用原则
时间:2022-03-17 阅读:537
羊源性成分探针法荧光定量PCR试剂盒通用原则:
1, 先选择好探针,然后设计引物使其尽可能的靠近于探针。
2, 扩增子的长度应不超过400bp,理想的*能在100-150bp内,扩增片断约短,有效的扩增反应就越容易获得。较短的扩增片断也容易保证分析的一致性
3, 保持GC含量在20%和80%之间,GC富含区容易产生非特异反应,从而会导致扩增效率的降低,及在SG分析中非特异信号。
4, 为了保证效率和重复性,应避免重复的核苷酸序列,尤其是G(不能有4个连续的G)
5, 将引物和探针互相进行配对检测,以避免二聚体和发卡结构的形成。
b),探针设计指导
1,在设计引物之前设计探针
2,探针的Tm值应在68-70℃之间,如果是目测探针,则要仔细审查GC富含区。
3,探针的5’端要避免有鸟an酸,5’G会有淬灭作用,即使被切割下来这种淬灭作用也还会存在
4,选择C多于G的链作探针,G的含量多于C会降低反应效率,这时就应选择配对的另一条链作为探针。
6, 探针应尽可能的短,不要超过30个bp。
7, 检测探针的DNA折叠和二级结构。
小鼠神经干细胞(EGFP标记)
人脑微血管内皮细胞
人脑血管平滑肌细胞
人海马神经元
人少突胶质细胞
人星形胶质细胞
小鼠成纤维细胞(EGFP标记)
mCF, 小鼠心脏成纤维细胞
MN-c, 小鼠皮质神经元
MN-h, 小鼠海马神经元
MSC, 小鼠雪旺细胞
MA, 小鼠星形胶质细胞
MLF, 小鼠淋巴成纤维细胞
mRTEC, 小鼠肾小管上皮细胞
CSC, 小鼠心肌细胞
mEPC, 小鼠内皮祖细胞-骨髓
MEF, 小鼠胚胎成纤维细胞
NSC,大鼠神经干细胞
RN-h, 大鼠海马趾神经元
rEPC,大鼠内皮祖细胞-骨髓
RN-c, 大鼠皮质神经元
RN-s, 大鼠纹状体神经元
RSC, 大鼠雪旺细胞
RA, 大鼠星形胶质细胞
RLF, 大鼠淋巴成纤维细胞
rRTEC, 大鼠肾小管上皮细胞
rCSC, 大鼠心肌细胞
RDFs, 大鼠真皮成纤维细胞
RLFs, 大鼠肺成纤维细胞
rCF, 大鼠心脏成纤维细胞
MN-h, 小鼠海马神经元
MN-s, 小鼠纹状体神经元
mOPC, 小鼠少突胶质前体细胞
MA, 小鼠星形胶质细胞
MLF, 小鼠淋巴成纤维细胞
mRTEC, 小鼠肾小管上皮细胞
CSC, 小鼠心肌细胞
小鼠骨髓间充质干细胞(BMSCs)
MEF, 小鼠胚胎成纤维细胞