应用基因表达谱芯片研究人腹主动脉瘤细胞周期和细胞凋亡相关基因
时间:2013-04-08 阅读:823
应用基因表达谱芯片研究人腹主动脉瘤细胞周期和细胞凋亡相关基因
目的筛选腹主动脉瘤发生过程中与正常组织差异表达的细胞周期和细胞凋亡相关基因并作初步功能分析. 方法应用Trizol一步法抽提2块腹主动脉瘤壁及2块正常主动脉组织总RNA后,Oligotex mRNA Spin-Column操作法分离纯化组织mRNA;经逆转录合成荧光分子(Cy3/Cy5)标记cDNA探针,与微矩阵排列的含有4 096种cDNA基因的表达谱芯片杂交,利用GenePix Pro 3.0软件分析动脉瘤与正常组织中差异表达的基因,对所获得的基因进行分子生物信息学分析. 结果腹主动脉瘤与正常组织间差异表达的细胞周期和应用基因表达谱芯片研究人腹主动脉瘤细胞周期和细胞凋亡相关基因
细胞凋亡基因有18条,占芯片基因总数的0.44%.其中与细胞周期相关的基因11条,与细胞凋亡相关的基因7条.在动脉瘤组织中表达上调的基因9条,平均Ratio值为3.860,表达下调的9条,平均Ratio值为0.294.生物信息学分析显示,该18条差异表达细胞周期和细胞凋亡基因与腹主动脉瘤中平滑肌细胞的生长和凋亡有关. 结论腹主动脉瘤的发生、发展过程中存在多基因表达调控的改变,细胞周期和细胞凋亡基因与腹主动脉瘤中平滑肌细胞等的生长和凋亡有相关性,对于该相关基因群的进一步研究有助于阐释腹主动脉瘤的发病机制.