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全基因组甲基化测序技术(WGBS)可以在全基因组范围内检测所有单个胞嘧啶碱基(C碱基)的甲基化水平。能为基因组DNA甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术服务,能广泛应用在个体发育、衰老和疾病等生命过程的机制研究中,也是各物种甲基化图谱研究的优选方法。可应用于稀有样本,如胚胎细胞、肿瘤干细胞等的全基因组甲基化研究。
全基因组甲基化测序技术(WGBS)常规起始量WGBS:运用约1微克的基因组DNA进行文库构建和重亚硫酸盐处理。可根据物种基因组大小和测序数据量增加构建文库的个数,减少测序bias,确保甲基化检测的准确性。
数据解读分析内容
1.数据产出、过滤和质控
。下机数据过滤和质控图表
2.数据比对、甲基化信息
。比对结果、Bisulfite转化率统计
。覆盖度以及覆盖深度统计
。甲基化修饰位点及水平结果
3.甲基化修饰特征 .
。甲基化修饰位点和水平的特征及统计
4.差异甲基化修饰区域
。差异甲基化修饰区域(DMR)的鉴定和注释
5.差异甲基化修饰基因
。差异甲基化修饰基因功能和通路分析
样本要求