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尼康显微镜E200在显微镜内部的主要位置使用了防霉涂层，增加防霉条，这种设计能够阻止霉菌的生长。经过测试，经过防霉处理的显微镜能够连续3年在平均30度的温度和80%的湿度下阻止霉菌的生长。

尼康显微镜E200

坚实防震的结构
从臂到主体的连体结构，位于主机上的上下移动的机械结构的载物台，加上1888.5毫米的宽大的底座，这些都提供的很高的坚固度和抗震强度，为能得到出众的图象起了很大的作用。
改良的目镜筒
新型的目镜筒可自由倾斜30度，这样就能确保您在自然的姿势下进行舒适的观察，为适合各种体型的操作者，目镜筒拥有精细的47毫米的瞳间距调节范围，通过简单的把目镜筒前端部分旋转180度，当瞳间距为64毫米时，眼点高度可以被提升34毫米。为了身高特别高的使用者，可以使用眼点提升器来定制显微镜。

*的再定焦载物台减少手动调焦的需要
再定焦载物台减少了手动调焦的需要，使得操作样本更加简单和安全。在这个*的设计上，在更换标本或滴油时载物台可以通过按压使载物台下降，当手移开时载物台又会马上回到原先的位置，宽大的载物台表面可以同时容纳2块载玻片。

上限位制动器
当使用短工作距离的物镜时，如40X或更大，你可以设置载物台移动的上限位，这样物镜就不会撞到标本，就可以来保护两者.感谢这个功能，有它即使是初学者或行家，他们需要经常的更换标本，都可以更加容易和快速的进行操作。限制的高度可以通过一个制动螺丝来设置2个位置—标准的位置或低于2毫米的位置。这个功能对于标准的载玻片非常的有用，但是不*被使用到特别薄的载玻片上。