调控区域靶向捕获甲基化测序技术
产品简介
详细信息
调控区域靶向捕获甲基化测序技术（LHC-Seq）是通过设计相应的探针序列，特异性捕获感兴趣的基因片段，捕获序列进一步通过重亚硫酸盐处理，高通量测序分析目标区域的甲基化水平。该技术是大样本量，固定区域甲基化检测的优选，可广泛应用于临床样本甲基化特异性区域的鉴定以及与疾病相关的甲基化Bio-Marker的筛选和验证。
调控区域靶向捕获甲基化测序技术可服务的范围如下：
- 常规芯片捕获服务包括自主研发的全基因组启动子及关键调控区域的芯片（promoter capture-BS）、全外显子芯片（exome-BS）及NimbleGen的SeqCap Epi芯片等
- 个性化探针设计，可根据不同需要协助完成靶区域的探针合成及相关服务
- 提供单样本杂交和多样本混合后pooling杂交的服务策略，可*地降低实验成本。
数据解读分析内容
- 数据产出、过滤和质控
- 下机数据过滤和质控图表，去污染、接头
- 统计reads长度，reads数据，数据产量
- 数据比对、甲基化信息
- 比对结果、Bisulfite转化率统计，捕获效率统计
- 目标区域内覆盖度以及覆盖深度统计
- 目标区域内甲基化修饰位点及水平结果
- 甲基化修饰特征
- 目标区域甲基化修饰水平的特征及统计
- 差异甲基化修饰区域
- 差异甲基化修饰区域(DMR)的鉴定和注释
- 差异甲基化修饰基因
- 差异甲基化修饰基因功能和通路分析。
样本要求
- 样品类型：无降解，无污染的DNA样品；
- 样品需求量：单个样本杂交的起始量大于3μg；多样本混合杂交，每个样本的基因组DNA量大于1.5μg。
- 样品浓度：≥30 ng/μl;
- 样品纯度：OD260/280=1.8~2.0，不含蛋白和RNA等污染